Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ERCC6Q03468 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ERCC6Q03468 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms