Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms