Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF17Q02223 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF17Q02223 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms