Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPCAP84074 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HPCAP84074 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HPCAP84074 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPCAP84074 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPCAP84074 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPCAP84074 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPCAP84074 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPCAP84074 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPCAP84074 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPCAP84074 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPCAP84074 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPCAP84074 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPCAP84074 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HPCAP84074 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPCAP84074 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPCAP84074 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPCAP84074 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPCAP84074 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPCAP84074 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HPCAP84074 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms