Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIM1P81133 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIM1P81133 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIM1P81133 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIM1P81133 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms