Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERVK_113P63132 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms