Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA52P62987 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms