Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNAP25P60880 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNAP25P60880 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms