Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTBP60709 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTBP60709 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTBP60709 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTBP60709 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms