Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms