Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARFIP2P53365 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms