Protein–RNA interactions for Protein: P51164

ATP4B, Potassium-transporting ATPase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4BP51164 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4BP51164 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4BP51164 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4BP51164 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4BP51164 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4BP51164 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4BP51164 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4BP51164 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4BP51164 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4BP51164 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4BP51164 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4BP51164 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4BP51164 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4BP51164 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP4BP51164 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP4BP51164 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms