Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMPHP49418 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMPHP49418 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMPHP49418 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMPHP49418 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPHP49418 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPHP49418 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPHP49418 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPHP49418 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPHP49418 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPHP49418 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPHP49418 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPHP49418 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPHP49418 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPHP49418 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPHP49418 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPHP49418 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPHP49418 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPHP49418 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPHP49418 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPHP49418 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMPHP49418 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMPHP49418 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms