Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRPC1P48995 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms