Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GNPDA1P46926 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms