Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP5P45974 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP5P45974 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP5P45974 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP5P45974 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP5P45974 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP5P45974 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP5P45974 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP5P45974 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP5P45974 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP5P45974 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP5P45974 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP5P45974 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP5P45974 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP5P45974 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP5P45974 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP5P45974 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP5P45974 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP5P45974 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP5P45974 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP5P45974 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP5P45974 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP5P45974 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP5P45974 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP5P45974 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP5P45974 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP5P45974 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP5P45974 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP5P45974 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP5P45974 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP5P45974 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms