Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACADSBP45954 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACADSBP45954 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms