Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL1P40616 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARL1P40616 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ARL1P40616 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ARL1P40616 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ARL1P40616 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ARL1P40616 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ARL1P40616 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
ARL1P40616 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL1P40616 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL1P40616 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL1P40616 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL1P40616 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL1P40616 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL1P40616 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL1P40616 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL1P40616 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL1P40616 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL1P40616 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL1P40616 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL1P40616 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL1P40616 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARL1P40616 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms