Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRCA1P38398 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRCA1P38398 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRCA1P38398 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
BRCA1P38398 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms