Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM23P36406 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms