Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SFTPDP35247 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTPDP35247 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms