Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP2P32456 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP2P32456 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP2P32456 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP2P32456 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP2P32456 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP2P32456 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP2P32456 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP2P32456 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP2P32456 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP2P32456 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP2P32456 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP2P32456 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP2P32456 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP2P32456 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GBP2P32456 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GBP2P32456 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GBP2P32456 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GBP2P32456 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBP2P32456 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP2P32456 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms