Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 IRAK4-202ENST00000440781 1409 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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HOXD11P31277 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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HOXD11P31277 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD11P31277 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 PAXIP1-AS2-201ENST00000397551 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD11P31277 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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