Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms