Protein–RNA interactions for Protein: P30939

HTR1F, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1FP30939 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HTR1FP30939 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms