Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPIFP30405 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPIFP30405 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPIFP30405 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPIFP30405 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PPIFP30405 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PPIFP30405 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPIFP30405 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PPIFP30405 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PPIFP30405 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PPIFP30405 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PPIFP30405 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PPIFP30405 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PPIFP30405 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PPIFP30405 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PPIFP30405 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPIFP30405 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPIFP30405 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPIFP30405 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPIFP30405 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPIFP30405 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPIFP30405 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PPIFP30405 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPIFP30405 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPIFP30405 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPIFP30405 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPIFP30405 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPIFP30405 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms