Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHATP28329 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHATP28329 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHATP28329 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHATP28329 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHATP28329 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHATP28329 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHATP28329 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHATP28329 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHATP28329 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHATP28329 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms