Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSFA2P28290 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSFA2P28290 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms