Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5F1P24539 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms