Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF4P23510 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms