Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USF1P22415 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF1P22415 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF1P22415 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms