Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK11BP21127 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms