Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA1P20827 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms