Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGCP20142 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGCP20142 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGCP20142 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGCP20142 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGCP20142 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGCP20142 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGCP20142 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGCP20142 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms