Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPEP16870 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPEP16870 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPEP16870 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPEP16870 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CPEP16870 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPEP16870 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CPEP16870 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPEP16870 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPEP16870 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPEP16870 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPEP16870 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPEP16870 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPEP16870 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPEP16870 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPEP16870 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPEP16870 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPEP16870 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPEP16870 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CPEP16870 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CPEP16870 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CPEP16870 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CPEP16870 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CPEP16870 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CPEP16870 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CPEP16870 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CPEP16870 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CPEP16870 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CPEP16870 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CPEP16870 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CPEP16870 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CPEP16870 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CPEP16870 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms