Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GNB3P16520 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB3P16520 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB3P16520 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB3P16520 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB3P16520 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB3P16520 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms