Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms