Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MUC1P15941 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MUC1P15941 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MUC1P15941 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MUC1P15941 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MUC1P15941 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms