Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms