Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms