Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms