Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NR2F1P10589 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms