Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HKR1P10072 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HKR1P10072 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HKR1P10072 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HKR1P10072 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HKR1P10072 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HKR1P10072 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HKR1P10072 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HKR1P10072 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HKR1P10072 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HKR1P10072 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HKR1P10072 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HKR1P10072 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HKR1P10072 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HKR1P10072 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HKR1P10072 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms