Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM225BP0DP42 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms