Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms