Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAA2P0DJI9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms