Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC2BP0DI82 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms