Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NGFRP08138 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NGFRP08138 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms