Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB1P08034 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB1P08034 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB1P08034 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB1P08034 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB1P08034 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB1P08034 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB1P08034 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB1P08034 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB1P08034 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB1P08034 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB1P08034 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB1P08034 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB1P08034 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GJB1P08034 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GJB1P08034 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GJB1P08034 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB1P08034 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB1P08034 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB1P08034 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB1P08034 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB1P08034 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB1P08034 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB1P08034 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB1P08034 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB1P08034 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB1P08034 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GJB1P08034 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms