Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTMAP06454 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTMAP06454 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTMAP06454 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTMAP06454 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTMAP06454 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTMAP06454 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTMAP06454 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTMAP06454 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTMAP06454 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTMAP06454 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTMAP06454 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTMAP06454 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTMAP06454 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTMAP06454 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTMAP06454 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTMAP06454 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTMAP06454 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTMAP06454 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTMAP06454 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTMAP06454 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTMAP06454 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTMAP06454 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTMAP06454 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTMAP06454 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTMAP06454 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTMAP06454 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTMAP06454 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTMAP06454 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTMAP06454 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTMAP06454 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTMAP06454 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTMAP06454 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms